Im Bereich der Knochenaufbau-Techniken hat Prof. Dr. Nickenig mehrere minimalinvasive Vorgehensweisen entwickelt und publiziert. Zum Beispiel verspricht eine spezielle 3-D basierte Knochenaufbautechnik im Oberkiefer-Seitenzahnbereich günstigere Einheilergebnisse und geringere Nebenwirkungen (z.B. Schwellungen, Schmerzen). Weitere 3-D basierte Verfahren zur Knochenverbreiterung im Ober- und Unterkiefer werden von Ihm in modernster, optimierter Technik mit Ultraschall anstatt herkömmlichen Instrumenten angewendet.